肌腱移植在运动医学领域中已经得到了广泛的应用。自体或异体的肌腱被用于重建各种韧带，如前交叉韧带（ACL）、后交叉韧带（PCL）、内侧副韧带（MCL）、外侧副韧带（LCL）、髌骨内侧韧带（MPFL）、踝关节外侧副韧带（前距腓韧带，ATFL和跟腓韧带，CFL）、踝关节下胫腓联合韧带、跟腱、肘关节尺侧副韧带等等。这些重建技术均已成熟并经过了大量病例临床随访的考验。然而，对患者来说，一个令人纠结的问题是：选用自体腱还是异体腱？
的确，自体腱和异体腱各有优缺点，我们列出两种肌腱详细的优缺点，供患者选择：
自体腱：自体腱多采用内侧腘绳肌腱，即股薄肌腱和半腱肌腱。
优点：
1. 副作用较小，术后一般不会有大的后遗症；
2. 与自身组织的相容性好，容易愈合；
3. 重塑过程较快；
缺点：
1. 需要额外的手术时间，一般在15分钟以内；
2. 取出的肌腱可能不能满足手术需要，如不够长或不够粗；
3. 存在额外的手术损伤，术后可能导致取腱处疼痛；
4. 术后将导致部分膝关节功能损失，表现为内旋肌力下降30%，屈膝肌力下降10%。
此外，也有人选用腓骨短肌、腓骨长肌、股四头肌等，但其优缺点大多类似。